Contexte
L’approche One Health est un challenge pour l’action publique. La lutte contre l’antibiorésistance s’inscrit dans cette approche, qui reconnait que la santé humaine, animale, et environnementale sont étroitement liées et interdépendantes. Cette approche appliquée à l’antibiorésistance part du principe que la résistance des bactéries aux antibiotiques est une problématique intersectorielle et multidisciplinaire qu’il n’est pas possible de résoudre en l’abordant uniquement sous l’angle sanitaire.
C’est pourquoi dans le cadre de ses missions, PROMISE a souhaité établir et concevoir un entrepôt de données de surveillance commun orienté One Health, rassemblant et croisant les éléments relatifs aux humains, aux animaux et aux écosystèmes.
Objectifs et méthode
L’entrepôt de données One Health commun a pour but de rassembler les données de surveillance de trois secteurs. Les objectifs affichés sont multiples. D’une part, cet entrepôt facilite l’accès aux données de surveillance et leur visualisation. En effet, la data visualisation rend plus rapide l’analyse de données, en plus de rendre accessible l’interprétation à des personnes non-spécialiste de la donnée. D’autre part, cette base commune permet de croiser les données plus facilement, afin d’ouvrir la voie à une surveillance plus intégrée de l’antibiorésistance, de mettre en lumière de nouveaux axes de recherche et de produire du contenu valorisant (rapports, analyses, modèles, illustrations, etc.).
Il faut savoir que cet entrepôt est construit selon une approche en gestion de projet « bottom-up », c’est à dire qui consiste à collecter les données « de terrain » pour aboutir à une synthèse et faire remonter les éléments pertinents de manière la plus efficiente possible. Cela passe par :
- la mise en place d’un inventaire (Data Management Plan, workshops, groupes de travail, etc.) ;
- la définition de variables et d’indicateurs (spatio-temporel, données de résistance, pathogènes, etc.) ;
- l’intégration (soit définir un protocole pour collecter des données issues de nombreuses sources) ;
- l’analyse (soit la mise à disposition d’une source de données unique pour répondre à des besoins de recherche).
Média associé
Le fonctionnement de l’entrepôt de données commun One Health
Cet entrepôt rassemble des données de consommation, relatives à la résistance et des données d’exposome. Cela représente l’ensemble des facteurs d’exposition chimique, cliniques et environnementaux rendus interopérables grâce à l’expertise bio-informatique de l’INRIA (Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique), membre du projet PROMISE, spécialisé dans le développement de la recherche et de la valorisation en sciences et techniques de l’information et de la communication.
